Analysis of p16 gene mutations and deletions in childhood acute lymphoblastic leukemias

Autores

  • José Alexandre Rodrigues Lemos Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto, Universidade de São Paulo
  • Ricardo Defavery Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto, Universidade de São Paulo
  • Carlos Alberto Scrideli Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto, Universidade de São Paulo
  • Luiz Gonzaga Tone Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto, Universidade de São Paulo

Palavras-chave:

Leucemia, Linfoblástica, Aguda, Gene, Supressor, Tumor, p16

Resumo

CONTEXTO: O gene supressor tumoral p16 codifica uma proteína inibidora da quinase ciclina dependente 4(cdk4) que bloqueia a divisão celular na fase G1 do ciclo celular. Alterações neste gene foram relatadas em várias neoplasias, incluindo as leucemias linfoblásticas agudas, principalmente da linhagem T. OBJETIVO: Verificar prováveis alterações do gene p16 em leucemias linfoblásticas agudas em crianças, utilizando o método de reação de polimerase em cadeia - polimorfismo conformacional em fita simples e seqüenciamento direto de nucleotídeos e comparar a sobrevida livre de eventos com a presença ou não de alterações (deleções ou substituições de bases) do gene p16, utilizando o método de Kaplan-Meir e teste log-rank. TIPO DE ESTUDO: Estudo retrospectivo. LOCAL: Departamento de Puericultura e Pediatria da Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto da Universidade de São Paulo. PARTICIPANTES: Foram estudadas 56 crianças (16 do sexo feminino e 40 do masculino) com leucemia aguda com idade média de quatro anos. Quarenta pacientes (71,43%) tinham leucemias linfoblásticas agudas de células B, 12 (21,43%) tinham leucemias linfoblásticas agudas de células T e 4 (7,1%) eram bifenotípicas. AMOSTRA: Amostras de DNA foram extraídas de medula óssea obtidas ao diagnóstico e/ou na recaída. Em dois casos de leucemias linfoblásticas agudas de células T, o DNA obtido do líquido céfalo-raquidiano foi analisado. VARIÁVEIS ESTUDADAS: Deleções ou substituições de bases nos éxones 1, 2 e 3 do gene p16 foram determinadas pela reação de polimerase em cadeia - polimorfismo conformacional em fita simples e seqüenciamento de nucleotídeos. A sobrevida livre de eventos foi determinada segundo o método de Kaplan-Meier e teste log-rank para pacientes com gene p16 normal e alterado. RESULTADOS: Em cinco casos (quatro leucemias linfoblásticas agudas pré B CALLA+ e uma leucemia linfoblástica aguda T) foram observadas deleções no éxon 3. Foram verificadas migrações anômalas no polimorfismo conformacional em fita simples em sete casos no éxon 1, seis no éxon 2 e cinco no éxon 3. A confirmação da mutação pelo seqüenciamento direto do DNA ocorreu em quatro casos no éxon 1 e 2 no éxon 2. Foram comparadas as curvas de sobrevida pelo método de Kaplan-Meier e teste log-rank e não se obteve diferença estatisticamente significativa da sobrevida livre de eventos em cinco anos entre os grupos de criança com leucemia linfoblática aguda com p16 normal e alterado e também entre os pacientes com leucemia linfoblástica aguda B com p16 normal e alterado. Não foi possível avaliar pelo método de Kaplan-Meier os pacientes com leucemia linfoblástica aguda T devido ao pequeno número de casos. CONCLUSÕES: Os resultados obtidos, principalmente em relação à freqüência de deleções, foram concordantes com vários autores que sugerem que deleções do gene p16 possam ser eventos iniciais da gênese leucêmica. Tendo em vista o pequeno número de amostras estudadas, não foi possível realizar a correlação entre leucemia linfoblática aguda na infância e as mutações de ponto no gene p16 encontradas neste estudo. Não se obteve significância estatística entre sobrevida livre de eventos e alterações do p16 em leucemia linfoblática aguda pelo método de KaplanMeier. A freqüência de alterações do p16 em leucemia linfoblástica aguda B e T foram concordantes com os estudos realizados em alguns centros mundiais. Sugerimos a realização de uma pesquisa multicêntrica com um maior número de casos, principalmente sobre leucemia linfoblástica aguda T, a fim que seja possível traçar um perfil de alterações do gene p16 em crianças brasileiras.

Downloads

Não há dados estatísticos.

Biografia do Autor

José Alexandre Rodrigues Lemos, Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto, Universidade de São Paulo

MD. Biologist, Department of Pediatrics, Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto, Universidade de São Paulo, Ribeirão Preto, São Paulo, Brazil.

Ricardo Defavery, Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto, Universidade de São Paulo

MD. Assistant physician, Department of Pediatrics, Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto, Universidade de São Paulo, Ribeirão Preto, São Paulo, Brazil.

Carlos Alberto Scrideli, Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto, Universidade de São Paulo

MD. Assistant physician, Department of Pediatrics, Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto, Universidade de São Paulo, Ribeirão Preto, São Paulo, Brazil.

Luiz Gonzaga Tone, Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto, Universidade de São Paulo

MD. Associate professor, Department of Pediatrics, Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto, Universidade de São Paulo, Ribeirão Preto, São Paulo, Brazil.

Referências

Grandér D. How do mutated oncogenes and tumor suppressor genes cause cancer? Med Oncol 1998;15(1):20-6.

Hunter T, Pines J. Cyclins and cancer. II: Cyclin D and CDK inhibitors come of age. Cell 1994;79(4):573-82.

Schafer KA. The cell cycle: a review. Vet Pathol 1998;35(6):461-78.

Hannon GJ, Beach D. p15INK4B is a potential effector of TGF- beta-induced cell cycle arrest. Nature 1994;371(6494):257-61.

Serrano M, Hannon GJ, Beach D. A new regulatory motif in cell-cycle control causing specific inhibition of cyclin D/CDK4. Nature 1993;366(6456):704-7.

Caldas C, Hahn SA, da Costa LT, et al. Frequent somatic muta- tions and homozygous deletions of the p16 (MTS1) gene in pancreatic adenocarcinoma. Nat Genet 1994;8(1):27-32.

Cairns P, Mao L, Merlo A, et al. Rates of p16 (MTS1) muta- tions in primary tumors with 9p loss. Science 1994;265(5170):415-7.

Nobori T, Miura K, Wu DJ, Lois A, Takabayashi K, Carson DA. Deletions of the cyclin-dependent kinase-4 inhibitor gene in multiple human cancers. Nature 1994;368(6473):753-6.

Guo SX, Taki T, Ohnishi H, et al. Hypermethylation of p16 and p15 genes and RB protein expression in acute leukemia. Leuk Res 2000;24(1):39-46.

Yamada Y, Hatta Y, Murata K, et al. Deletions of p15 and/or p16 genes as a poor-prognosis factor in adult T-cell leukemia. J Clin Oncol 1997;15(5):1778-85.

Fizzotti M, Cimino G, Pisegna S, et al. Detection of homozygous deletions of the cyclin-dependent kinase 4 inhibitor (p16) gene in acute lymphoblastic leukemia and association with adverse prognostic features. Blood 1995;85(10):2685-90.

Diccianni MB, Batova A, Yu J, et al. Shortened survival after relapse in T-cell acute lymphoblastic leukemia patients with p16/ p15 deletions. Leuk Res 1997;21(6):549-58.

Carter TL, Reaman GH, Kees UR. INK4A/ARF deletions are acquired at relapse in childhood acute lymphoblastic leukemia: a paired study on 25 patients using real-time polymerase chain reaction. Br J Haematol 2001;113(2):323-8.

Kees UR, Ranford PR, Hatzis M. Deletions of the p16 gene in pediatric leukemia and corresponding cell lines. Oncogene 1996;12(10):2235-9.

Maloney KW, McGavran L, Odom LF, Hunger SP. Acquisition of p16(INK4A) and p15(INK4B) gene abnormalities between initial diagnosis and relapse in children with acute lymphoblas- tic leukemia. Blood 1999;93(7):2380-5.

Ohnishi H, Hanada R, Horibe K, et al. Homozygous deletions of p16/MTS1 and p15/MTS2 genes are frequent in t (1;19)- negative but not in t (1;19)-positive B precursor acute lymphob- lastic leukemia in childhood. Leukemia 1996;10(7):1104-10.

Rasool O, Heyman M, Brandter LB, et al. p15ink4B and p16ink4 gene inactivation in acute lymphocytic leukemia. Blood 1995;85(12):3431-6.

Otsuki T, Clark HM, Wellman A, Jaffe ES, Raffeld M. Involve- ment of CDKN2 (p16 INK4A/MTS1) and p15INK4B/MTS2 in human leukemias and lymphomas. Cancer Res 1995;55(7):1436-40.

Stranks G, Height SE, Mitchell P, et al. Deletions and rearrangements of CDKN2 in lymphoid malignancy. Blood 1995;85(4):893-901.

Okuda T, Shurtleff SA, Valentine MB, et al. Frequent deletion of p16INK4a/MTS1 and p15INK4b/MTS2 in pediatric acute lymphoblastic leukemia. Blood 1995;85(9):2321-30.

Haidar MA, Cao XB, Manshouri T, et al. p16INK4A and p15INK4B gene deletions in primary leukemias. Blood 1995;86(1):311-5.

Takeuchi S, Bartram CR, Seriu T, et al. Analysis of a family of cyclin-dependent kinase inhibitors: p15/MTS2/INK4B, p16/ MTS1/INK4A, and p18 genes in acute lymphoblastic leukemia of childhood. Blood 1995;86(2):755-60.

Delmer A, Tang R, Senamaud-Beaufort C, Paterlini P, Brechot C, Zittoun R. Alterations of cyclin-dependent kinase 4 inhibi- tor (p16 INK4A/MTS1) gene structure and expression in acute lymphoblastic leukemias. Leukemia 1995;9(7):1240-5.

Iolascon A, Faienza MF, Coppola B, della Ragione F, Schettini F, Biondi A. Homozygous deletions of cyclin-dependent kinase in- hibitor genes, p16(INK4A) and p18, in childhood T cell lineage acute lymphoblastic leukemias. Leukemia 1996:10(2):255-60.

Cayuela JM, Hebert J, Sigaux F. Homozygous MTS1 (p16INK4A) deletion in primary tumor cells of 163 leukemic patients. Blood 1995;85(3):854.

Cayuela JM, Madani A, Sanhes L, Stern MH, Sigaux F. Multi- ple tumor-suppressor gene 1 inactivation is the most frequent genetic alteration in T-cell acute lymphoblastic leukemia. Blood 1996:87(6):2180-6.

Hayette S, Thomas X, Bertrand Y, et al. Molecular analysis of cyclin-dependent kinase inhibitors in human leukemias. Leukemia 1997;11(10):1696-9.

Nakao M, Yokota S, Kaneko H, et al. Alterations of CDKN2 gene structure in childhood acute lymphoblastic leukemia: mu- tations of CDKN2 are observed preferentially in T lineage. Leukemia 1996;10(2):249-54.

Ogawa S, Hangaishi A, Miyawaki S, et al. Loss of the cyclin- dependent kinase 4-inhibitor (p16; MTS1) gene is frequent in and highly specific to lymphoid tumors in primary human hematopoietic malignancies. Blood 1995;86(4):1548-56.

Quesnel B, Preudhomme C, Philippe N, et al. p16 gene ho- mozygous deletions in acute lymphoblastic leukemia. Blood 1995;85(3):657-63.

Rubnitz JE, Behm FG, Pui CH, et al. Genetic studies of child- hood acute lymphoblastic leukemia with emphasis on p16, MLL, and ETV6 gene abnormalities: results of St Jude Total Therapy Study XII. Leukemia 1997;11(8):1201-6.

Okuda T, Shurtleff SA, Valentine MB, et al. Frequent deletion of p16INK4a/MTS1 and p15INK4b/MTS2 in pediatric acute lymphoblastic leukemia. Blood 1995;85(9):2321-30.

Brenner MK, Pinkel D. Cure of leukemia. Semin Hematol 1999;36(4 Suppl 7):73-83.

Schröder M, Mathieu U, Dreyling MH, et al. CDKN2 gene deletion is not found in chronic lymphoid leukaemias of B- and T-cell origin but is frequent in acute lymphoblastic leukae- mia. Br J Haematol 1995;91(4):865-70.

Kees UR, Burton PR, Lü C, Baker DL. Homozygous deletion of the p16/MTS1 gene in pediatric acute lymphoblastic leukemia is associated with unfavorable clinical outcome. Blood 1997;89(11):4161-6.

Michaelides K, Schwaab R, Lalloz MRA, Schmidt W, Tuddenham JL. Mutational analysis: New mutations. In: McPherson MJ, Hames BD, Taylor GR, editors. PCR 2: A practical approach. Oxford: Oxford University Press; 1995.p257-88.

Washimi O, Nagatake M, Osada H, et al. In vivo occurrence of p16 (MTS1) and p15 (MTS2) alterations preferentially in non- small cell lung cancers. Cancer Res 1995;55(3):514-7.

Okamoto A, Hussain SP, Hagiwara K, et al. Mutations in the p16INK4/MTS1/CDKN2, p15INK4B/MTS2, and p18 genes in primary and metastatic lung cancer. Cancer Res 1995;55(7):1448-51.

Yoshida S, Todoroki T, Ichikawa Y, et al. Mutations of p16Ink4/ CDKN2 and p15Ink4B/MTS2 genes in biliary tract cancers. Cancer Res 1995;55(13):2756-60.

Volm M, Koomägi R, Stammler G, Rittgen W, Zintl F, Sauerbrey

A. Prognostic implications of cyclins (D1, E, A), cyclin-depend- ent kinases (CDK2, CDK4) and tumor-suppressor genes (pRB, p16INK4A) in childhood acute lymphoblastic leukemia. Int J Cancer 1997;74(5):508-12.

Downloads

Publicado

2003-03-03

Como Citar

1.
Lemos JAR, Defavery R, Scrideli CA, Tone LG. Analysis of p16 gene mutations and deletions in childhood acute lymphoblastic leukemias. Sao Paulo Med J [Internet]. 3º de março de 2003 [citado 10º de março de 2025];121(2):58-62. Disponível em: https://periodicosapm.emnuvens.com.br/spmj/article/view/2593

Edição

Seção

Artigo Original